Základní aktivity Školního zemědělského podniku jsou tvořeny souhrnem tří základních činností, přičemž úspěšnost jedné z nich podmiňuje realizaci i úroveň další.

Rozsahem a finančním vlivem je největší část výrobní, která meziročně vzrostla o 12 %, v absolutních číslech o částku 4 mil. Kč. Ze střednědobého hlediska došlo za posledních 8 let ke 100 % nárůstu výkonů představujících hodnotu 20 mil. Kč.

Podnik tak mohl projít rozsáhlou modernizací strojového parku i technologií v rozsahu téměř 60 mil. Kč bez přímé finanční účasti univerzity. Po dokončení těchto makro změn je možné přejít na výraznou modernizaci účelových zařízení v areálu Čtyři Dvory s jejichž započetím se počítá již v plánu roku 2007.

Na základě několikaletých praktických zkušeností je dnes možné doporučit i optimální velikost účelového zařízení, za kterou je považována výměra 1300 – 1500 ha zemědělské půdy s ročním obratem cca 50 mil. Kč a ziskem 5 mil. Kč. Účelně upravená struktura takového celku umožní bezproblémovou realizaci praktických cvičení, praxí, diplomových prací studentů i řešení grantových a vědeckovýzkumných úkolů pracovníků ZF JU.

Snaha vedení ŠZP JU směřuje k tomu, aby studenti nejen zpracovávali a vyhodnocovali získané výsledky experimentů jiných, ale aby příslušný tématický okruh sami navrhovali a v celém jeho průběhu řídili. Tím získají daleko lepší orientaci v dané problematice, naučí se systematičnosti i zodpovědnosti za vyřešení konkrétního úkolu.

Tímto se dostáváme k nosnému programu činnosti ŠZP JU, jímž je účelová činnost. V roce 2006 proběhla zejména v areálu účelového zařízení Čtyři Dvory praktická cvičení v rozsahu 9043 studentohodin. Provozní praxe posluchačů I. ročníků a odborné praxe posluchačů IV. ročníků představovaly vytížení ŠZP JU v rozsahu 9480 studentohodin. Spolu s obdobnou činností studentů Střední školy veterinární a zemědělské, kteří v rámci střediska praxe odcvičili cca 20000 studentohodin, bylo na školním podniku absolvováno téměř 40000 studentohodin výuky a praxí.V rámci plánu na rok 2007 předpokládáme realizovat kompletní výměnu technologie chovu prasat s výraznou orientací na ukázky moderních trendů, jak ustájení, tak výživy chovaných zvířat. Finanční náročnost této operace představuje částku 500 tis. Kč a bude hrazena z provozních prostředků. V obdobném trendu bude ŠZP JU pokračovat i v příštích letech.

Z hlediska spolupráce ŠZP JU s jednotlivými katedrami lze pozitivně hodnotit využívání chovu koní, pro které bylo v roce 2006 vytvořeno zázemí ve formě kryté jízdárny, dále pak s katedrou anatomie a fyziologie hospodářských zvířat, kde probíhají permanentní pokusy u stáda ovcí. Stejným způsobem probíhá i spolupráce s katedrou genetiky a výživy zvířat, již několik let pokračují práce na regeneraci České červinky, ročně proběhnou 3 pokusy u turnusů výkrmu drůbeže a v poslední době byl zahájen pokus v chovu koz. Spolupráce s ostatními katedrami probíhají dle ročního plánu, je však nutné konstatovat, že dosud málo využívaný je úsek poloprovozních a provozních pokusů, jejichž výsledky by měly bezprostřední vliv na další orientaci hospodaření ŠZP JU.

Poslední, ne však nepodstatnou část naší činnosti tvoří projekt „Zelená laguna“ http://www.sosvaz.cz/laguna i zapojení ŠZP JU a jeho pracovníků do práce krajského informačního a poradenského centra http://www.kisjk.cz. Zde v rámci projektu Interreg III.A proběhla v letech 2003-2007 řada akcí.